Het meldingssysteem van SEIN laat dierenartsen weten wanneer er een geval of uitbraak van een infectieziekte is bevestigd, en in welk gebied. Voorheen ging dit enkel om de respiratoire aandoeningen droes, rhinopneumonie (EHV1/4) en influenza, evenals de abortus en neurologische variant van rhinopneumonie, maar inmiddels is dit verder uitgebreid. Zo is Rhodococcus equi toegevoegd aan SEIN en is de lijst verder uitgebreid met teekgebonden aandoeningen en gastro-intestinale ziekteverwekkers.